مطالعه نظری مکانیسم مولکولی فعال کننده های آنزیم کربونیک آنهیدراز (2) در حضور حلال آب بوسیله محاسبات مکانیک کوانتومی

پایان نامه
  • وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه
  • نویسنده مونا طاهری
  • استاد راهنما مینا غیاثی
  • تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
  • سال انتشار 1392
چکیده

کربونیک آنهیدراز یک آنزیم فلزدار حاوی روی است که یکی از مهمترین واکنش های فیزیولوژیکی، واکنش برگشت پذیر تبدیل دی اکسیدکربن به یون بیکربنات را در تمامی بافت ها کاتالیز می کند. در این کار پژوهشی، واکنش فعالسازی ایزومر ii آنزیم کربونیک آنهیدراز با آمین ها، آمینواسیدها و مشتقات آنها به عنوان فعال کننده با محاسبات مکانیک کوانتومی مطالعه شده است. نظریه تابعی چگالی در سطح b3lyp و با توابع پایه 6-31g و 6-31g* برای محاسبه جزئیات ساختار الکترونی و انرژی الکترونی فرم های فعال و غیرفعال مرکز فعال ایزومر ii آنزیم کربونیک آنهیدراز بکار گرفته شد. دو فعال کننده مهم زیستی این آنزیم شامل هیستامین و هیستیدین است که کمپلکس های بین این فعال کننده ها و مرکز فعال آنزیم مطابق با ساختار کریستالی به طور کامل مطالعه شد. همچنین کلیه توابع ترمودینامیکی شامل ?h°، ?g°و s°? برای واکنش کلی و برای تشکیل کمپلکس بین این دو فعال کننده و آنزیم، محاسبه گردید. نتایج حاصل نشان می دهد که قسمت پروتون پذیر مولکول های فعال کننده مانند هیستامین و هیستیدین در انتقال پروتون از مولکول آب متصل به فلز روی برای تشکیل گونه های فعال کاتالیستی آنزیم، روی-هیدروکسید، شرکت می کند تا سیکل کاتالیزوری از سر گرفته شود. در تمامی محاسبات اثرات حلال، برای حلال آب و با روش pcm انجام شده است.

۱۵ صفحه ی اول

برای دانلود 15 صفحه اول باید عضویت طلایی داشته باشید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مطالعه نظری مکانیسم واکنش تبدیل دی اکسید کربن به بی کربنات توسط آنزیم کربونیک آنهیدراز به روش محاسبات مکانیک کوانتومی از دیدگاه ترمودینامیکی

کربونیک آنهیدراز (ca) آنزیمی حاوی فلز روی میباشد که واکنش برگشت پذیر تبدیل گاز دی اکسید کربن به بی کربنات را کاتالیز میکند. این آنزیم برای سیستم های زیستی و از جمله بدن انسان بسیار مهم است. در این کار تحقیقاتی به بررسی عملکرد آنزیم کربونیک آنهیدراز در این واکنش توسط نظریه تابعی چگالی(dft) در سطحb3lyp و با سری پایهg* 31-6 در فاز گاز و حلال به روش pcm پرداخته شده است و متغیرهای ترمودینامیکی (?h...

محاسبات مکانیک مولکولی و بررسی تأثیر حلال بر اثرات محیطی و ترمودینامیکی آنزیم کولین استیل ترانسفراز

چکیده زمینه و هدف: فعالیت استیل کولین و آنزیم استیل کولین ترانسفراز در بیماری آلزایمر بررسی و مشخص شده است. از این جهت، نقص آنها می‌تواند باعث کاهش حافظه و یادگیری شود. میدان‌های نیرو، بر ساختار کولین استیل ترانسفراز تأثیر دارند. برای درک اثرات فضایی، برخی مطالعات کامپیوتری انجام شده است. مواد و روش‌ها: روش‌های شبیه سازی مونت کارلو ،دینامیک مولکولی و دینامیک لانگوین به‌وسیله‌ی میدان‌های نیروی...

متن کامل

مطالعه نظری برهمکنش برخی از فعال کننده ها با فرم های مختلف آنزیم کربونیک آنهیدراز از دیدگاه ترمودینامیکی

مکانیسم فعال سازی بتا کربونیک آنهیدراز و گاما کربونیک آنهیدراز با آمین¬ها و آمینو اسیدها با محاسبات مکانیک کوانتومی مطالعه شده است. دو روش برای محاسبه جزئیات ساختار الکترونی و انرژی الکترونی ترکیبات و کمپلکس¬های مختلف در طول مکانیسم واکنش بکار گرفته شد. آنالیز کنفورماسیونی دو فعال کننده بتا کربونیک آنهیدراز شامل ایزومر فنیل آلانین و ایزومر تیروزین و دو فعال کننده گاما کربونیک آنهیدراز شامل 2-...

محاسبات مکانیک مولکولی و بررسی تأثیر حلال بر اثرات محیطی و ترمودینامیکی آنزیم کولین استیل ترانسفراز

چکیده زمینه و هدف: فعالیت استیل کولین و آنزیم استیل کولین ترانسفراز در بیماری آلزایمر بررسی و مشخص شده است. از این جهت، نقص آنها می تواند باعث کاهش حافظه و یادگیری شود. میدان های نیرو، بر ساختار کولین استیل ترانسفراز تأثیر دارند. برای درک اثرات فضایی، برخی مطالعات کامپیوتری انجام شده است. مواد و روش ها: روش های شبیه سازی مونت کارلو ،دینامیک مولکولی و دینامیک لانگوین به وسیله ی میدان های نیروی...

متن کامل

مطالعه توتومری NH2NO (H2O/NH3)n=1,2,3 در فاز گاز/حلال با استفاده از محاسبات کوانتومی

در این تحقیق تعادلات توتومری نیتروز آمین و حالت گذار حاصل از انتقال 1و3 اتم هیدروژن با استفاده از محاسبات کوآنتومی مورد بررسی قرار گرفت. تعادلات در حضور یک تا سه مولکول (آب و آمونیاک) و به صورت دیمر و تریمر نیز انجام شد. بدین منظور انرژی و ساختارهای بهینه با استفاده از نظریه تابعیت چگال با استفاده از تابعیت B3LYP و سری پایه 6-311++G(d,P) در فاز گاز بدست آمدند. توسط محاسبات فرکانسی، توابع ترمودی...

متن کامل

مطالعه توتومری nh۲no (h۲o/nh۳)n=۱,۲,۳ در فاز گاز/حلال با استفاده از محاسبات کوانتومی

در این تحقیق تعادلات توتومری نیتروز آمین و حالت گذار حاصل از انتقال 1و3 اتم هیدروژن با استفاده از محاسبات کوآنتومی مورد بررسی قرار گرفت. تعادلات در حضور یک تا سه مولکول (آب و آمونیاک) و به صورت دیمر و تریمر نیز انجام شد. بدین منظور انرژی و ساختارهای بهینه با استفاده از نظریه تابعیت چگال با استفاده از تابعیت b3lyp و سری پایه 6-311++g(d,p) در فاز گاز بدست آمدند. توسط محاسبات فرکانسی، توابع ترمودی...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


نوع سند: پایان نامه

وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023